Создайте в панели сайт для домена, подключите SSL, создайте через панель letsencrypt-сертификат. Посмотрите в конфигах (apache/nginx) сайта пути к файлам сертификата. Замените в конфиге ISPConfig текущие пути к файлам сертификата панели на пути, которые смотрели в конфигах сайта. Перезапустите apache/nginx. Всё, радуйтесь. Как-то так.MiraMaX166 писал(а):Есть один вопрос, как создать ключ для корневого домена (точнее для домена на котором крутится сама панель).
З.Ы. Эту процедуру (по замене путей к сертификатам) нужно повторять после каждого upgrade панели. Чтобы сертификат обновлялся автоматически, созданный сайт удалять не нужно.